MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510d

Total Repeats: 1807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013858	TAA	2	6	534169	534174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013858	ATC	2	6	534216	534221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013858	A	6	6	534251	534256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013858	CGA	2	6	534271	534276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013858	GACG	2	8	534302	534309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_013858	CG	3	6	534328	534333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013858	GAT	2	6	543664	543669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013858	CA	3	6	543687	543692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013858	GAA	2	6	543714	543719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013858	CA	3	6	543739	543744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013858	ATC	2	6	543757	543762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013858	CCG	2	6	543805	543810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_013858	GCCC	2	8	544116	544123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1514	NC_013858	GCGG	2	8	544131	544138	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_013858	CGC	2	6	544167	544172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_013858	ACC	2	6	544176	544181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_013858	GGGC	2	8	544209	544216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_013858	CAT	2	6	544223	544228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013858	TCT	2	6	546295	546300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_013858	AAG	2	6	546361	546366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013858	CCT	2	6	546377	546382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_013858	GGC	2	6	546436	546441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013858	ACC	2	6	546466	546471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_013858	TCC	2	6	547335	547340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_013858	GGC	2	6	547345	547350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013858	ATC	2	6	547407	547412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013858	CGG	2	6	547419	547424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_013858	ACGCC	2	10	547475	547484	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1529	NC_013858	GC	3	6	547499	547504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013858	GGC	2	6	547524	547529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013858	TGC	2	6	549233	549238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_013858	CGC	2	6	549306	549311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_013858	GAC	2	6	549340	549345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013858	CG	3	6	549367	549372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_013858	CG	3	6	549386	549391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_013858	CCG	2	6	549428	549433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_013858	GAT	2	6	549482	549487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013858	CGG	2	6	549493	549498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013858	CG	3	6	549516	549521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_013858	CCG	2	6	549571	549576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_013858	GGC	2	6	549627	549632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_013858	TGG	2	6	550705	550710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013858	ACGC	2	8	551139	551146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_013858	CCG	2	6	552295	552300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_013858	CGG	2	6	552342	552347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_013858	CG	3	6	552368	552373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_013858	AG	3	6	552385	552390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013858	CGC	2	6	553309	553314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_013858	CGC	2	6	553877	553882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_013858	CCGCC	2	10	553893	553902	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1551	NC_013858	CAT	2	6	553916	553921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013858	CGC	2	6	553981	553986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_013858	GC	3	6	554000	554005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_013858	GAT	2	6	555946	555951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013858	GCG	2	6	555952	555957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013858	C	7	7	557017	557023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1557	NC_013858	CGG	2	6	557830	557835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013858	CCG	2	6	557991	557996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_013858	GGC	2	6	557999	558004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013858	CGA	2	6	558022	558027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013858	TCA	2	6	558033	558038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013858	GCC	2	6	558057	558062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_013858	GCG	2	6	558718	558723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_013858	GT	3	6	558787	558792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013858	GCGA	2	8	558840	558847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_013858	AGG	2	6	558873	558878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013858	GGCGG	2	10	558889	558898	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_013858	CGG	2	6	559009	559014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013858	CGG	2	6	560200	560205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013858	CT	3	6	560212	560217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_013858	C	6	6	560218	560223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1572	NC_013858	GC	3	6	560239	560244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_013858	CG	3	6	560247	560252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_013858	CGG	2	6	560365	560370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013858	CGG	2	6	560565	560570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013858	GCGG	2	8	560596	560603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_013858	CGG	2	6	560613	560618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_013858	TGCA	2	8	562207	562214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_013858	GGC	2	6	562232	562237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_013858	CCT	2	6	563720	563725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_013858	TC	3	6	564835	564840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_013858	TCG	2	6	564975	564980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_013858	GCT	2	6	565043	565048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_013858	C	6	6	565063	565068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1585	NC_013858	CGGG	2	8	565084	565091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_013858	GCGG	2	8	565092	565099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_013858	GTC	2	6	565115	565120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_013858	CTG	2	6	565142	565147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013858	CAG	2	6	565151	565156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_013858	GCC	2	6	565157	565162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_013858	GGA	2	6	565172	565177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013858	CGGGGA	2	12	565193	565204	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1593	NC_013858	CGG	2	6	565231	565236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013858	TCCCG	2	10	565249	565258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1595	NC_013858	CCG	3	9	565263	565271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_013858	CCG	2	6	565273	565278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_013858	CATGT	2	10	565293	565302	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_013858	GC	3	6	565312	565317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_013858	GCC	2	6	565320	565325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_013858	CAT	2	6	565379	565384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013858	CGG	2	6	565400	565405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013858	CATGC	2	10	565432	565441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_013858	GGC	2	6	565476	565481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_013858	G	6	6	565528	565533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013858	CCG	2	6	565546	565551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_013858	GCC	2	6	565599	565604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_013858	AT	3	6	565613	565618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013858	GACGG	2	10	566723	566732	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_013858	AGG	2	6	566744	566749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013858	AAC	2	6	568458	568463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013858	GGC	2	6	568499	568504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013858	GCC	2	6	568519	568524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_013858	CGG	2	6	568553	568558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013858	GAC	2	6	568674	568679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013858	GCGA	2	8	568718	568725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_013858	CCCT	2	8	568830	568837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1617	NC_013858	CGGGA	2	10	568842	568851	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1618	NC_013858	TGG	2	6	570043	570048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013858	GGC	2	6	570053	570058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013858	GAA	2	6	570066	570071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013858	G	6	6	570072	570077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013858	CG	3	6	570096	570101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_013858	CGC	2	6	570167	570172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_013858	TCG	2	6	570353	570358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013858	CG	3	6	570360	570365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_013858	TGA	2	6	570366	570371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013858	GTT	2	6	570405	570410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013858	GCC	2	6	570936	570941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_013858	CGG	2	6	570961	570966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_013858	TCC	2	6	572091	572096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_013858	GGC	2	6	572108	572113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013858	GGT	2	6	572144	572149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013858	CAC	2	6	572159	572164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_013858	ACAA	2	8	574589	574596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_013858	GGA	2	6	574604	574609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013858	CGG	2	6	576144	576149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1774	NC_013858	ACGGG	2	10	619616	619625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1775	NC_013858	CGC	2	6	619637	619642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1776	NC_013858	CGG	2	6	619652	619657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1777	NC_013858	CAA	2	6	619678	619683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1778	NC_013858	C	6	6	619747	619752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1779	NC_013858	TGC	2	6	619768	619773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1780	NC_013858	CGC	2	6	619795	619800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1781	NC_013858	TCCTC	2	10	621830	621839	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1782	NC_013858	GGT	2	6	621894	621899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1784	NC_013858	GTC	2	6	621982	621987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1786	NC_013858	GATG	2	8	622014	622021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1788	NC_013858	CGGC	2	8	622092	622099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1789	NC_013858	AGCC	2	8	622100	622107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1790	NC_013858	GCC	2	6	622166	622171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1791	NC_013858	CCG	2	6	622195	622200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1792	NC_013858	GCA	2	6	622216	622221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1793	NC_013858	GCC	2	6	622250	622255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1794	NC_013858	TCGCG	2	10	622257	622266	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1795	NC_013858	CGC	2	6	622285	622290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1796	NC_013858	CGT	2	6	622312	622317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1797	NC_013858	CCG	2	6	622318	622323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1798	NC_013858	CGCC	2	8	622328	622335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1799	NC_013858	AAC	2	6	622405	622410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1801	NC_013858	TCC	2	6	622448	622453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1802	NC_013858	CCG	2	6	626156	626161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1805	NC_013858	CGG	2	6	627084	627089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1806	NC_013858	GCG	2	6	628026	628031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1807	NC_013858	GC	4	8	628035	628042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.